胃肠道间质瘤的严重程度需根据肿瘤大小、位置、分裂活性等因素综合判断。部分小型低危肿瘤可能无须特殊治疗，而大型高危肿瘤可能引发出血、梗阻甚至转移。
体积较小的胃肠道间质瘤通常生长缓慢，多数无明显症状，可能通过体检偶然发现。这类肿瘤若位于胃部且直径小于2厘米，内镜下切除后复发概率较低。部分患者仅需定期随访观察，无须立即干预。但肿瘤若位于十二指肠或直肠等特殊部位，即使体积较小也可能因解剖位置复杂增加治疗难度。
具有高危特征的胃肠道间质瘤可能侵犯周围器官或发生远处转移。肿瘤直径超过5厘米、核分裂象超过5个/50HPF或存在特定基因突变时，术后复发风险显著升高。这类患者可能出现呕血、黑便、肠梗阻等急症，需联合手术与靶向药物治疗。晚期转移性肿瘤虽难以根治，但伊马替尼等酪氨酸激酶抑制剂可有效控制病情进展。
建议确诊后通过增强CT或超声内镜明确肿瘤分期，根据危险度分级制定个体化方案。日常需避免辛辣刺激饮食，观察排便颜色变化，定期复查监测复发迹象。出现腹痛加剧、体重骤降等异常时应及时返院评估。
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