神经内分泌癌的存活期差异较大，从数月到数十年不等，主要取决于肿瘤分级、原发部位、转移情况及治疗反应。低级别肿瘤患者经规范治疗后可能长期生存，高级别或广泛转移者预后较差。
局限期高分化神经内分泌癌患者5年生存率可达60%-90%，例如胰腺神经内分泌肿瘤中无转移的G1级患者。这类肿瘤生长缓慢，对手术切除反应良好，部分病例甚至可达到临床治愈。中肠来源的神经内分泌肿瘤即使出现肝转移，经肝动脉栓塞等综合治疗后仍可能存活5-10年。生存优势与肿瘤分泌激素类型相关，非功能性肿瘤通常比功能性肿瘤预后更好。
低分化神经内分泌癌患者中位生存期常不足1年，小细胞型神经内分泌癌广泛期患者生存期通常为10-12个月。这类肿瘤增殖指数高，早期易发生血行转移，对放化疗敏感性随时间递减。原发于肺或胰腺的低分化神经内分泌癌侵袭性更强，多发骨转移或脑转移患者生存期可能缩短至3-6个月。治疗抵抗性、恶病质进展及严重内分泌综合征会显著影响生存质量。
规范的多学科诊疗可延长生存期，建议患者定期进行生长抑素受体显像评估，根据分级调整治疗方案。保持营养状态、控制激素相关症状、预防骨相关事件有助于改善预后。参加新型靶向药物或肽受体放射性核素治疗的临床试验可能为晚期患者提供生存机会。
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