一、试剂介绍
Cyanine2 COOH 是一个非常经典的菁染料家族成员，而“普通荧光染料”是一个很宽泛的概念。为了进行有意义的对比，我们将其与最常用、最具代表性的其他类型荧光染料，特别是 FITC 和之前提到的 HEX 进行对比。
1. 化学结构与稳定性
Cyanine2 (Cy2)：
属于菁染料。其结构特征是两端含氮杂环通过聚次甲基桥相连。这种对称的共轭体系赋予了它优良的光物理性质。
COOH（羧基） 是活性基团，用于与蛋白质的氨基在偶联剂（如EDC）作用下形成稳定酰胺键。
优势：结构稳定，光漂白耐受性强，对pH变化和溶剂极性不敏感，在不同环境中荧光信号更可靠。
普通荧光染料（以FITC为例）：
属于异硫氰酸荧光素。其异硫氰酸酯基团可直接与蛋白质氨基反应，但键合稳定性有时不如酰胺键。
劣势：极易发生光漂白，在激光照射下信号衰减快。其荧光强度高度依赖pH值，在生理pH或酸性细胞器（如溶酶体）中亮度会大幅下降。
HEX：
是荧光素的六氯代衍生物。氯原子的引入使其光谱红移（更偏黄绿），并提高了光稳定性和淬灭耐受性。
主要用于核酸标记（作为磷酰胺单体），在DNA环境中性能卓越。
2. 光谱特性
Cy2 vs FITC：
两者光谱高度重叠，Cy2的激发和发射峰通常比FITC略蓝移2-5nm。这意味着它们可以使用几乎相同的滤光片组（如标准的FITC滤光片）。
在流式细胞仪或荧光显微镜上，Cy2可以直接替代FITC，且能获得更好、更稳定的信号。
Cy2 vs HEX：
光谱区别明显。Cy2是蓝绿色，HEX是黄绿色。HEX的激发峰在535nm左右，需要用绿色激光器（如532nm）或滤镜组激发，而Cy2用标准的488nm蓝光激发。
因此，它们在多色实验中占据不同通道，不会相互干扰。
3. 性能与适用性
亮度：Cy2的摩尔消光系数和量子产率很高，与FITC同属高亮度染料，足以检测低丰度目标。
稳定性（最关键优势）：
Cy2的光稳定性远胜FITC。这对于需要长时间曝光或时间序列成像的实验（如活细胞成像）至关重要。
Cy2的pH不敏感性使其在酸性或碱性微环境中都能保持稳定亮度，而FITC在细胞内pH不均一时信号会有偏差。
偶联与背景：Cy2的磺化形式（如Cy2 NHS ester）水溶性更好，标记后染料聚集少，非特异性背景更低。
二、试剂属性
中文名称：碘乙酰胺CY5
英文名称：Cy2 (iodine) ；Cyanine2 (iodine))；Cyanine2 COOH；Cyanine2 carboxylic acid
CAS号：186205-37-8
分子式：C25H27IN2O4
分子量：546.4
纯度：≥95%
外观：固体、液体
品牌：陕西新研博美生物科技有限公司
溶解性：常溶于水或极性有机溶剂
储存条件：-20°C 干燥避光保存，避免反复冻融
规格：5mg，10mg，25mg
结构式：
三、相关试剂
5-Carboxyfluorescein diacetate，5-diacetate FAM
5-FAM DBCO，5-Carboxyfluorescein DBCO
5-FITC-PEG4-azide，Fluorescein-PEG4-N3
5-FITC-PEG4-NHS ester，Fluorescein-PEG4-NHS
6-FAM PEG3-COOH，6-Carboxyfluorescein-PEG3-acid
5-FAM Maleimide，5-Carboxyfluorescein-MAL
5-FITC-PEG6-COOH，Fluorescein-PEG6-acid
5-FITC-PEG4-Amine，Fluorescein-PEG4-NH2
5-FITC-PEG3-NHBoc，Fluorescein-PEG3-NHBoc
5-FITC-PEG4-COOH，Fluorescein-PEG4-acid
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该试剂只用于科研实验，不能用于人体。
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